"Tra cinque anni"
Nel quinto anniversario dell'esplosione di New York, l'Hiro del passato entra nello studio di Mendez, ma al posto del solito studio con tele, vernici e pennelli trovano una stanza piena di fili colorati che s'intrecciano tra loro. Hiro Futuro capisce che con il salvataggio di Claire, l'Hiro del passato è adesso in grado di uccidere Sylar e impedire che questo futuro apocalittico abbia luogo. Matt entra con una squadra di agenti della Sicurezza Nazionale e arresta l'Hiro del passato mentre l'Hiro del futuro e Ando si tele-trasportano a Las Vegas per cercare Peter.Ando e Hiro entrano in un locale di Las Vegas per cercare Peter, trovando Jessica su un palco che esegue uno strip molto sexy. Alla fine dello spettacolo i due le chiedono informazioni ma lei risponde che Peter non è interessato a loro. Hiro allora chiede se sa dove si trova Bennet ma lei crede che sia in Texas, ad allevare bestiame. Quando Niki va al bancone del bar di fianco a lei appare Peter che fino ad ora era stato invisibile: una cicatrice gli attraversa il viso.Nel frattempo l'Hiro del passato è tenuto prigioniero da Matt Parman e l'Haitiano. Matt interroga Hiro sui suoi atti di terrorismo ma non scopre niente, nemmeno con l'uso della lettura del pensiero, visto che l'Hiro del passato non ne è a conoscenza. Si scopre che nel futuro le persone con abilità sono costrette a nascondersi dalla società perchè considerati un pericolo. Matt spiega tutto al suo capo superiore, il presidente degli Stati Uniti, ovvero Nathan Petrelli.Nathan parla con il professor Mohinder Suresh per sapere a che punto è lo studio dei poteri genetici e per una possibile cancellazione di queste abilità, visto che la gente ha paura di un altro Sylar in circolazione. Ordina quindi di usare il siero che ha progettato anche se non è sicuro che funzioni o che possa provocare la morte di una persona. Inoltre gli ordina di andare a New York dove è stato catturato Hiro Nakamura.In Texas il Signor Bennet aiuta le famiglie con componenti "speciali" a mettersi in salvo, dando loro false identità e campioni di sangue estranei, assieme a lui ad aiutarlo c'è Hana Gilman. Arrivano l'Hiro del futuro e Ando in cerca di aiuto, ma Bennet si rifiuta. Tra le loro discussioni Ando rivela che Claire è viva grazie al messaggio di Hiro dal futuro. Bennet rimane sorpreso e presto capiscono il perchè. Claire infatti è viva, lontana da casa e sotto falsa identità.A New York il professor Suresh scopre che il giorno in cui era in metropolitana con Peter Petrelli tutte le parole del ragazzo erano vere, inoltre trova un numero del fumetto 9th Wonders! e lo prende con sè, poi va dall'Hiro del passato per procedere con il primo test per fermare le abilità delle persone speciali.Claire è viva, lontana da casa e sotto falsa identità: si chiama Sandra e ha i capelli castano scuro, lavora in un caffè, ha un fidanzato e presto si sposerà, ma l'arrivo di suo padre porta nuove notizie. Lui infatti la informa che sanno che è viva e le chiede di cambiare vita un'altra volta dandogli una nuova identità.Mentre l'Hiro del futuro studia un piano per salvare l'Hiro del passato, Ando chiede informazioni sul suo futuro, ma non riceve alcuna risposta. La Sicurezza Nazionale invade l'appartamento in cui si trovano e i due sembrano essere catturati, quando appare Peter Petrelli che in grande stile atterra le guardie, poi ferma il tempo e mette in salvo i due eroi.Matt Parkman rimane a mani vuote. Si scopre che è stato il Signor Bennet ad averlo informato, sicuro della sua scelta perchè Matt sa i suoi segreti e lui ha messo in salvo la sua famiglia (sua moglie Janice e suo figlio Matthew). Ma il loro accordo termina in quel momento.Claire chiede ad Andy di scappare con lei, promettendo di spiegargli tutto. Lui accetta, ma i loro piani vengono sconvolti da un cliente, che si rivela essere Matt. Nel frattempo, Suresh interroga Hiro e gli chiede se stia cercando di uccidere Sylar per cambiare il passato.A Las Vegas Peter rivela a Ando che lui nel futuro non esiste perchè è morto nell'esplosione e l'Hiro del futuro è diventato un vendicatore dopo quella perdita. Peter spiega il perché: dopo la morte di Ando nell'esplosione il senso di speranza e ottimismo di Hiro sono morti con lui. Quando Jessica li vede insieme, si infuria e se ne va.Suresh mette al corrente Nathan che Hiro stava per uccidere Sylar poco prima che si facesse esplodere e che è possible che questo possa essere evitato. Nathan dice a Suresh che stasera annuncerà alla popolazione che hanno trovato il modo di curare i poteri. Quando le prime persone cominceranno a morire, Nathan darà la colpa a Suresh. Questo unirà le persone nel dolore, come diceva Linderman. Matt entra e dice a Nathan di aver catturato i due Hiro. Nathan chiede a Suresh di eliminarli.Jessica litiga con Peter perché si ostina a voler lottare. I due urlano e Peter le rinfaccia di farsi chiamare Jessica sul palco quando non è vero. Peter urla che Jessica, DL e Micah sono tutti morti e che lei deve accettare di averli persi. Lui confessa di essere stato la causa dell'esplosione e non Sylar cme tutti credono. Nathan ha mentito per proteggerlo. "Se c'è una minima possibilità che Hiro possa cambiare gli eventi, io lo devo aiutare".Nel luogo in cui è esplosa la bomba, il presidente Petrelli fa un discorso sulla cura, appena trovata, per riuscire a cambiare il codice genetico delle persone con i poteri. Presto provvedimenti di sicurezza che stanno attualmente affliggendo le vite delle persone potranno essere ritirati, e la popolazione potrà vivere senza paura. Mentre le campane suonano cinque volte a significare cinque anni di dolore, Suresh si prepara ad uccidere Hiro.Hiro Futuro e Peter cominciano a combattere per entrare nel palazzo della Sicurezza Nazionale, mentre Matt e la sua squadra restano al piano di sopra con l'Haitiano perché la sua presenza annulla i poteri. Quando Hiro lo supplica di lasciarlo in vita, Suresh uccide l'haitiano al posto suo.Hiro Futuro entra sfondando la porta ed Hiro Passato gli dice di non uccidere Suresh. Ando e Hiro Futuro si ritrovano insieme. Hiro Futuro dice di dover tornare indietro nel passato ma in quel momento entra Matt e gli spara alla schiena. Matt chiama Nathan durante la cerimonia e gli dice di avere ucciso Hiro Futuro ma di avere dei problemi con Peter.La folla di New York resta senza fiato quando Nathan vola via per scontrarsi con Peter. Peter capisce che Nathan è Sylar. "Quando ho ucciso Nathan, si era già messo contro quelli come lui". "Bugiardo", risponde Peter, mentre le sue mani cominciano a brillare per lo scontro finale.Mentre Suresh tiene la porta chiusa, e la luce proveniente dallo scontro tra Sylar e Peter comincia ad entrare nella stanza, Hiro Passato chiude gli occhi e riesce a tele-trasportare lui e Ando nel loro tempo.